在DSQ-2000L/S的基礎上，測序速度進一步被提高。DSQ-600系統是專為基因診斷等需要而設計，除快速測序外，并可廣泛用于PCR-SSCP分析，小衛星片段分析及凝膠位移分析等基礎研究。
隨著基因診斷進入實用階段，加速了從DNA水平闡述致病機理和功能的進程，并廣泛應用在基礎醫學、臨床醫學、動物學、藥物學、農業學、環境科學、法醫物證學等多種領域。人類基因組計劃的突飛發展使高速分析龐大基因組成為世人注目的焦點。為保證研究人員的安全、滿足日益增長的有效精確的序列分析之要求，島津制作所在原有DSQ-1000L/1000S型全自動熒光DNA序列儀的基礎上，不斷探索研究和改進，推出了全新一代的DSQ-2000L/2000S型DNA序列儀。這種新型的全自動DNA測序儀優化了序列反應、光學系統、凝膠電泳和數據傳送過程，提供高速而穩定的長片段序列分析及結果和多渠道操作，極大的加速了研究步伐。
