采用賴氨酸肽鏈內切酶,消解樣品,注入柱子進行純化,進行只針對多肽的C-末端肽鏈片段的特異性分離提取,繼之采用僅具N-末端測序功能的全自動蛋白/多肽序列儀對多肽測序,實現C-末端測序的要求。
對目的蛋白質或多肽采用賴氨酸肽鏈內切酶消解,將消解產物直接送入DITC柱內,分餾儀將自動的對其加熱,將各多肽片段的N-末端的α-氨基酸和賴氨酸(Lys)殘基的ε-氨基酸共價結合固定在DITC樹脂上,用三氟乙酸(TFA)將固定住的各片段中的N-末端的肽鏈結合的α-氨基酸裂解,將釋放出的C-末端片段收集。
收集的C-末端片段,不需要進一步純化,即可采用N-末端測序功能的全自動蛋白/多肽序列儀對多肽進行測序,實現C-末端測序的要求。